MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014495	A	7	7	17	23	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014495	AATT	2	8	1934	1941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014495	ACC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014495	A	8	8	2147	2154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014495	A	6	6	2160	2165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014495	TCA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014495	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014495	TCC	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014495	GAA	2	6	5956	5961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014495	TTA	2	6	6168	6173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014495	ACA	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014495	ATT	2	6	6232	6237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014495	T	6	6	6246	6251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014495	AG	4	8	6284	6291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014495	A	7	7	6298	6304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014495	GAA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014495	AGAA	2	8	6351	6358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014495	ACC	2	6	7696	7701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014495	ACC	2	6	7730	7735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014495	ACC	2	6	7763	7768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014495	GTAA	2	8	7769	7776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014495	ACC	2	6	7798	7803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014495	ATT	2	6	7949	7954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014495	T	6	6	7982	7987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014495	TTC	2	6	8015	8020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014495	AGG	2	6	10493	10498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014495	GAG	2	6	11290	11295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014495	T	7	7	11296	11302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014495	AAT	2	6	11307	11312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014495	T	8	8	11346	11353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014495	G	7	7	11938	11944	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014495	CTCC	2	8	12292	12299	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_014495	TTTA	2	8	12300	12307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014495	AAAAG	2	10	12335	12344	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014495	A	6	6	12362	12367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014495	TAT	2	6	12406	12411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014495	CTC	2	6	15620	15625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014495	TCC	2	6	16050	16055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014495	TAT	2	6	16069	16074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014495	AAG	2	6	16165	16170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014495	TAAA	2	8	16187	16194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014495	AT	3	6	17629	17634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014495	TCT	2	6	17700	17705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014495	A	6	6	18728	18733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014495	A	6	6	18807	18812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014495	A	6	6	18936	18941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014495	CA	3	6	18972	18977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014495	TA	3	6	19427	19432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014495	AAT	2	6	19443	19448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014495	AAT	2	6	19456	19461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014495	AAT	2	6	19469	19474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014495	ATT	2	6	19501	19506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014495	A	6	6	20388	20393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014495	ATTT	2	8	20398	20405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014495	GTAA	2	8	20457	20464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014495	TAT	2	6	20492	20497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014495	ACAAG	2	10	20510	20519	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014495	GAC	2	6	20529	20534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014495	ATT	2	6	20632	20637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014495	GCA	2	6	20642	20647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014495	T	6	6	20707	20712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014495	AGG	2	6	20735	20740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014495	ATG	2	6	20791	20796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014495	AAG	2	6	20798	20803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014495	GAAA	2	8	22710	22717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014495	CT	3	6	22795	22800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014495	GTA	2	6	23433	23438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014495	AAT	2	6	23451	23456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014495	T	6	6	23463	23468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014495	CT	3	6	23501	23506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014495	T	6	6	23510	23515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014495	T	6	6	23538	23543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014495	A	6	6	23565	23570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014495	TAAAA	2	10	23588	23597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014495	AG	3	6	23679	23684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014495	TAA	2	6	23773	23778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014495	ATA	2	6	23820	23825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014495	A	6	6	23843	23848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014495	ATG	2	6	23859	23864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014495	TTG	2	6	23892	23897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014495	TAA	2	6	23929	23934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014495	CAA	2	6	26993	26998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014495	ATT	2	6	27026	27031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014495	T	6	6	27039	27044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014495	T	7	7	27055	27061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014495	TAGAA	2	10	27085	27094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014495	T	6	6	27190	27195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014495	TAA	2	6	27238	27243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014495	ATTT	2	8	27830	27837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014495	GATA	2	8	27869	27876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014495	A	6	6	27935	27940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014495	AT	3	6	27942	27947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014495	A	6	6	27993	27998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014495	TA	3	6	28008	28013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014495	TTA	2	6	28047	28052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014495	AGG	2	6	28075	28080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014495	ATTAAA	2	12	30168	30179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014495	CCT	2	6	34846	34851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014495	TCA	2	6	34881	34886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014495	A	6	6	34910	34915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014495	T	6	6	37635	37640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014495	ATT	2	6	37643	37648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014495	GTTG	2	8	37809	37816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014495	TC	3	6	37818	37823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014495	ATCG	2	8	37917	37924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014495	GGTTGT	2	12	37953	37964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014495	GAT	2	6	38051	38056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014495	TGC	2	6	38086	38091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014495	ATA	2	6	38125	38130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014495	TA	3	6	38434	38439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014495	ATGTAA	2	12	38737	38748	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014495	ACATAT	2	12	38773	38784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014495	TAAT	2	8	38795	38802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014495	AT	3	6	38801	38806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014495	AGG	2	6	38813	38818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014495	AGA	2	6	40219	40224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014495	T	7	7	40884	40890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014495	AAT	2	6	40897	40902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014495	GTT	2	6	40937	40942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014495	ATG	2	6	40944	40949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014495	AGG	2	6	40987	40992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014495	TGA	2	6	42388	42393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014495	GA	3	6	43186	43191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014495	CT	3	6	44372	44377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014495	ATATT	2	10	44419	44428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014495	GTG	2	6	44520	44525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014495	ATA	2	6	44570	44575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014495	TTA	2	6	44576	44581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014495	TAA	2	6	44654	44659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014495	TTCT	2	8	44674	44681	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014495	AAG	2	6	44721	44726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014495	AT	4	8	44729	44736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014495	TA	4	8	44740	44747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014495	TA	3	6	44813	44818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014495	AGG	2	6	44847	44852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014495	TAA	2	6	47512	47517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014495	T	7	7	47553	47559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014495	CGA	2	6	47564	47569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014495	GTA	2	6	48288	48293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014495	CGG	2	6	48421	48426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014495	AGTCA	2	10	48435	48444	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014495	AGC	2	6	48481	48486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014495	TAAA	2	8	48500	48507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014495	CTA	2	6	48528	48533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014495	TAT	2	6	48546	48551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014495	GCT	2	6	48912	48917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014495	T	7	7	49024	49030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014495	ATAA	2	8	49059	49066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014495	CTT	2	6	49164	49169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014495	T	6	6	49204	49209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.